1.睑内翻及倒睫：在沙眼的后期病变可侵及睑板，因瘢痕组织收缩而变短，加之睑结膜特别是睑板上沟部位因瘢痕而收缩，遂使睑板向内弯曲如舟状，形成典型的睑内翻倒睫倒睫亦可单独发生，乃由于毛囊附近受病变侵犯后产生的瘢痕所致。倒睫的长期刺激可使角膜浅层呈现弥漫性点状浸润，继而上皮剥脱,形成溃疡，称沙眼性角膜炎或沙眼性角膜溃疡此时病人异物感、怕光、流泪疼痛、及视力模糊等症状。应及时作内翻矫正及电解倒睫术以免造成严重的损伤。

　　2.沙眼性角膜溃疡：在血管翳的末端有灰白色点状浸润一旦破溃，即形成浅层溃疡，这些溃疡可以互相融合形成小沟状溃疡。这种由沙眼血管翳所引起的溃疡，与倒睫所引起者均称为沙眼性角膜溃疡。前者以用药物治疗为主，后者应做手术矫正睑内翻倒睫

　　3.上睑下垂：由于上睑结膜及睑板组织增生肥厚使上睑重量增加；同时病变侵及苗勒氏肌和提上睑肌，使提睑功能减弱，因而发生上睑下垂治疗仍以沙眼为主。

　　4.沙眼性眼干燥症：由于结膜表面瘢痕化将结膜的付泪腺及杯状细胞完全破坏，泪腺排泄管在上穹窿部的开口也被封闭，粘液和泪液完全消失结膜及角膜变干燥，严重时结膜角膜呈弥漫性实质性混浊，上皮角化肥厚，形似皮肤、视力极度降低此时应点鱼肝油或人工泪液（含有甲基纤维素methylcellutose）以减轻结膜、角膜干燥。或行泪小点封闭术以减少泪液的流出。

　　5.泪道阻塞及慢性泪囊炎沙眼衣原体侵犯粘膜，可引起泪小管阻塞，或鼻泪管阻塞进而形成慢性泪囊炎。