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沙眼衣原体可用特殊检查方法检测。
女性感染此病还会导致不孕、宫外孕。孕妇患病，其新生儿经产道感染也可诱发眼结膜炎，或发生肺炎。沙眼衣原体感染可持续较长时间，需要及时而充分的治疗，否则容易迁延及复发。
一般可选用红霉素、四环素、磺胺类药物。青霉素对于这种非淋菌性尿道炎无效，如若合并淋病感染，才用青霉素。病菌在治疗后要重复多种化验。
配偶的治疗仍然是值得强调的。
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